Din anul 2012, in cadrul CERTIND SA s-a dezvoltat Departamentul de Managementul Proiectelor. Astfel ca din acel moment CERTIND SA a inceput sa se implice in proiecte cu finantare europeana. Proiectele in care s-a implicat CERTIND SA atat ca partener dar ca si contractor au fost finantate prin urmatoarele Programe Operationale:
 

•  Programul Operational Sectorial Dezvoltarea Resurselor Umane (POSDRU 2007-2013)
•  Programul Opera?ional Dezvoltarea Capacit??ii Administrative (PODCA 2007-2013)
•  Programul Operational Capacitate Administrativa (PO CA 2014-2020)
•  Programul Operational Capital Uman (PO CU 2014-2020)
•  Programul National de Dezvoltare Rurala (PNDR 2014-2020)