În functie de scop, dezinfectia poate fi:

• Dezinfectia profilactica – se executa lunar în unitatile sanitare, scolare sau de alimentatie publica. În restul unitatilor se executa trimestrial sau la cerere. Aceasta are scop preventiv
• Dezinfectia de necesitate – se efectueaza pentru combaterea unor boli infectioase sau parazitare, din momentul înregistrarii primelor cazuri si pâna la eliminarea întregului focar

În cazul dezinfectiei de necesitate se disting dezinfectia finala si dezinfectia curenta.